荔枝和龙眼都属于无患子科。
1、颜色不同
荔枝：荔枝的颜色为暗红色或鲜红色。
龙眼：龙眼的颜色为黄褐色或灰黄色。
2、果壳不同
荔枝：荔枝的果壳上有颗粒状的凸起。
龙眼：龙眼的果壳较光洁没有凸起，外壳相对荔枝来说会更硬、更脆。
3、大小不同
荔枝：荔枝的直径为2-3.5厘米。
龙眼：龙眼的直径为1.2-2.5厘米。
4、口感不同
荔枝：荔枝的口感甜，个别会带一点涩味。
龙眼：龙眼的口感比较甜腻，没有涩味。
参考资料来源：百度百科-龙眼
百度百科-荔枝
荔枝与龙眼有很大区别，味道、外皮、大小、口感都不同。同属无患子科。
荔枝（学名：Litchi chinensis Sonn.）原产于中国南部，是亚热带果树，常绿乔木，高约10米。果皮有鳞斑状突起，鲜红，紫红。果肉产鲜时半透明凝脂状，味香美，但不耐储藏。
龙眼，（拉丁学名：Dimocarpus longan Lour.）又称桂圆，益智，常绿大乔木，树体高大。7～8月果实成熟呈黄褐色时采摘。为无患子科植物，果供生食或加工成干制品，肉、核、皮及根均可作药用。原产于中国南部及西南部，世界上有多个国家和地区栽培龙眼
龙眼为中国南方水果，多产于两广地区。与荔枝、香蕉、菠萝同为华南四大珍果。其树高一二丈，叶长而略小，开白花，成实于初秋。其实累累而坠，外形圆滚，如弹丸却略小于荔枝，皮青褐色。去皮则剔透晶莹偏浆白，隐约可见内里红黑色果核，极似眼珠，故以“龙眼”名之。
泉州是全国龙眼主要产区之一，自古盛产龙眼。泉州人通称桂圆鲜果为龙眼，龙眼焙干后为桂圆。商户常把两者统称为“桂圆”。
龙眼原产我国南方，栽培历史可追溯到二千多年前的汉代。北魏（386―534年）・贾思勰《齐民要术》云：“龙眼一名益智，一名比目。”因其成熟于桂树飘香时节，俗称桂元。古时列为重要贡品。魏文帝（535―551年）曾诏群臣：“南方果之珍异者，有龙眼、荔枝，令岁贡焉。”
泉州地处东南沿海，气候适宜、雨量充沛，自古以来人文繁盛。优越的自然条件、 悠久的人文开发历史，促进了龙眼在泉州的栽培。
宋代，龙眼已在泉州普遍种植。
北宋・泉州府同安县人苏颂《图经本草》（1061年）载：“龙眼生南海山谷中，今闽、广、 蜀道出荔枝之处皆有之。
南宋，泉州郡守王十朋赞颂龙眼：“绝品轻红扫地无，纷纷万木以龙呼，实如益智本非药， 味比荔枝真是奴。”
明・黄仲昭《八闽通志》记述：“龙眼树似荔支，而叶微小， 皮黄褐色。荔支才过，龙眼即熟，故南人曰为荔支奴。泉州府诸县皆有，郡中（今鲤城区、丰泽区）尤盛。 ”
明・泉州人何乔远《闽书》记述泉州一带“园有荔枝，龙眼之利，焙而干之行天下。”
泉州龙眼用嫁接技术繁殖方法的历史已很久远。明・徐勃《荔枝谱》（1597年）和邓道协《荔枝谱》（1628年）都有关于龙眼用嫁接繁殖的记载。清初 ・周亮工《闽小记》（1666―1668年）和郭柏苍《闽产录异》都记载用嵌接法换种，沿用至今。旧法用挂钵填土。 泉州龙眼品种很多，风味不一。著名品种有普明庵本、红孩儿本等50多种。最受赞誉的首推“东璧”龙眼，1993年荣获中国农业博览会金奖。
“东璧”龙眼原产自泉州市区开元寺内东塔旁的原东璧寺一隅，因而得名。其母本是明・万历年间（1573―1620年）开元寺僧人种植的，历300多年至抗日战争期间才枯死。泉州承天寺内有一株已200多年的古龙眼树，是现存的“东璧”龙眼中树龄最长的。而今“东璧”龙眼，在泉州及本省其他龙眼产区均有广泛繁殖。传说早年仙游有个僧人从泉州开元寺取去“东璧”龙眼苗，在仙游境内栽植，现已繁衍2万株成年树，取名“泉州本”，但其品质逊于原产的“东璧”龙眼。
“东璧”龙眼品质优良。其果皮有淡黄色的虎斑纹，泉人称为“花壳”，是外观有别于其它龙眼品种的最显著区别。“东璧”龙眼又称“糖瓜蜜”，果肉呈淡白色，透明如凝脂，厚而嫩脆，甘甜清香，具有“放在纸上不沾湿，掸落地下不沾沙”的特点，堪称果中珍品。
另有“福眼”，原称“虎眼”。《泉州府志》有“大者名虎眼”的记载。泉语“虎”、“福”的音近，以“福眼”代替“虎眼”，取其吉祥美好之意。福眼是泉州的主栽品种，有800年以上的栽培历史，曾荣获国际巴黎旅游美食金质奖和中国农业博览会优质奖。近年全省各龙眼产区均有大量种植，是我省栽培面积最大的品种。据说台湾种植的大型龙眼，当地同胞也称“福眼”。
龙眼的药用
干龙眼即桂圆（桂元、元肉）。和荔枝性属湿热不同，龙眼能够入药，有壮阳益气、补益心脾、养血安神、润肤美容等多种功效，可治疗贫血、心悸、失眠、健忘、神经衰弱及病后、产后身体虚弱等症。
龙眼
拉丁名 Dimocarpus longan Lour.
中文名 龙眼
拉丁科名 Sapindaceae
中文科名 无患子科
保护级别 3
分布 广东（海南岛）
现状 渐危种。野生龙眼为海南西南部低丘陵季雨林中常见的树种之一。随着森林的破坏，大树多被砍伐，现存植株多是萌生幼树复壮而成的林木，分布区日益缩小，自然资源明显减少。
海拔下限(米)
海拔上限(米) 800
形态特征常绿乔木，高达20余米，胸径1米，板状根较明显；树皮黄褐色，粗糙，薄片状脱落。偶数羽状复叶，互生，长15－30厘米；小叶薄革质，长圆形或长圆状披针形，长6一15厘米，宽2.5一5.0厘米，先端急尖或稍钝。圆锥花序顶生和腋生，长12一15厘米，花杂性，簇生，黄白色；花粤5裂；花瓣5；雄蕊 8，着生花盘内侧；子房无柄，2一3室，密被长柔毛，有小瘤体，柱头2一3裂。
参考资料：
龙眼为中国南方水果，多产于两广地区。与荔枝、香蕉、菠萝同为华南四大珍果。其树高一二丈，叶长而略小，开白花，成实于初秋。其实累累而坠，外形圆滚，如弹丸却略小于荔枝，皮青褐色。去皮则剔透晶莹偏浆白，隐约可见内里红黑色果核，极似眼珠，故以“龙眼”名之。
泉州是全国龙眼主要产区之一，自古盛产龙眼。泉州人通称桂圆鲜果为龙眼，龙眼焙干后为桂圆。商户常把两者统称为“桂圆”。
龙眼原产我国南方，栽培历史可追溯到二千多年前的汉代。北魏（386―534年）・贾思勰《齐民要术》云：“龙眼一名益智，一名比目。”因其成熟于桂树飘香时节，俗称桂元。古时列为重要贡品。魏文帝（535―551年）曾诏群臣：“南方果之珍异者，有龙眼、荔枝，令岁贡焉。”
泉州地处东南沿海，气候适宜、雨量充沛，自古以来人文繁盛。优越的自然条件、 悠久的人文开发历史，促进了龙眼在泉州的栽培。
宋代，龙眼已在泉州普遍种植。
北宋・泉州府同安县人苏颂《图经本草》（1061年）载：“龙眼生南海山谷中，今闽、广、 蜀道出荔枝之处皆有之。
南宋，泉州郡守王十朋赞颂龙眼：“绝品轻红扫地无，纷纷万木以龙呼，实如益智本非药， 味比荔枝真是奴。”
明・黄仲昭《八闽通志》记述：“龙眼树似荔支，而叶微小， 皮黄褐色。荔支才过，龙眼即熟，故南人曰为荔支奴。泉州府诸县皆有，郡中（今鲤城区、丰泽区）尤盛。 ”
明・泉州人何乔远《闽书》记述泉州一带“园有荔枝，龙眼之利，焙而干之行天下。”
泉州龙眼用嫁接技术繁殖方法的历史已很久远。明・徐勃《荔枝谱》（1597年）和邓道协《荔枝谱》（1628年）都有关于龙眼用嫁接繁殖的记载。清初 ・周亮工《闽小记》（1666―1668年）和郭柏苍《闽产录异》都记载用嵌接法换种，沿用至今。旧法用挂钵填土。 泉州龙眼品种很多，风味不一。著名品种有普明庵本、红孩儿本等50多种。最受赞誉的首推“东璧”龙眼，1993年荣获中国农业博览会金奖。
“东璧”龙眼原产自泉州市区开元寺内东塔旁的原东璧寺一隅，因而得名。其母本是明・万历年间（1573―1620年）开元寺僧人种植的，历300多年至抗日战争期间才枯死。泉州承天寺内有一株已200多年的古龙眼树，是现存的“东璧”龙眼中树龄最长的。而今“东璧”龙眼，在泉州及本省其他龙眼产区均有广泛繁殖。传说早年仙游有个僧人从泉州开元寺取去“东璧”龙眼苗，在仙游境内栽植，现已繁衍2万株成年树，取名“泉州本”，但其品质逊于原产的“东璧”龙眼。
“东璧”龙眼品质优良。其果皮有淡黄色的虎斑纹，泉人称为“花壳”，是外观有别于其它龙眼品种的最显著区别。“东璧”龙眼又称“糖瓜蜜”，果肉呈淡白色，透明如凝脂，厚而嫩脆，甘甜清香，具有“放在纸上不沾湿，掸落地下不沾沙”的特点，堪称果中珍品。
另有“福眼”，原称“虎眼”。《泉州府志》有“大者名虎眼”的记载。泉语“虎”、“福”的音近，以“福眼”代替“虎眼”，取其吉祥美好之意。福眼是泉州的主栽品种，有800年以上的栽培历史，曾荣获国际巴黎旅游美食金质奖和中国农业博览会优质奖。近年全省各龙眼产区均有大量种植，是我省栽培面积最大的品种。据说台湾种植的大型龙眼，当地同胞也称“福眼”。
龙眼的药用
干龙眼即桂圆（桂元、元肉）。和荔枝性属湿热不同，龙眼能够入药，有壮阳益气、补益心脾、养血安神、润肤美容等多种功效，可治疗贫血、心悸、失眠、健忘、神经衰弱及病后、产后身体虚弱等症。
龙眼
拉丁名 Dimocarpus longan Lour.
中文名 龙眼
拉丁科名 Sapindaceae
中文科名 无患子科
保护级别 3
分布 广东（海南岛）
现状 渐危种。野生龙眼为海南西南部低丘陵季雨林中常见的树种之一。随着森林的破坏，大树多被砍伐，现存植株多是萌生幼树复壮而成的林木，分布区日益缩小，自然资源明显减少。
海拔下限(米)
海拔上限(米) 800
形态特征常绿乔木，高达20余米，胸径1米，板状根较明显；树皮黄褐色，粗糙，薄片状脱落。偶数羽状复叶，互生，长15－30厘米；小叶薄革质，长圆形或长圆状披针形，长6一15厘米，宽2.5一5.0厘米，先端急尖或稍钝。圆锥花序顶生和腋生，长12一15厘米，花杂性，簇生，黄白色；花粤5裂；花瓣5；雄蕊 8，着生花盘内侧；子房无柄，2一3室，密被长柔毛，有小瘤体，柱头2一3裂。
参考资料：
我的区分方法：荔枝颜色红。龙眼则是棕。；荔枝外表疙疙瘩瘩。龙眼较光滑。
都是无患子科。（好像，具体看别人的就行了）